方舟子的Blog

    贺福初“国际上首次发现”的肝细胞生成素成了2005年度国家自然科学奖建议授奖项目，贺福初当年伪造成果一事又进入人们的视野。有一位化名“白字秀才”的人（从其文风看，当是我们的老相识“宋非”、“4848”），在网上散发一篇题为《方舟子应该就hematopoietin,向贺福初等人叩头道歉》的文章，为贺福初鸣冤叫屈，在他看来，欺世盗名的不是贺福初，倒是方舟子了。

    我几年前在《一个成功的学术骗子贺福初院士》一文中指出：

    “根据贺福初实验室发表的论文和蛋白质序列，他号称首先发现、克隆并命名的肝细胞生成素HPO，虽然他将其英文写成hepatopoietin，但并不是肝细胞生长因子（hepatocyte growth factor，有时也写做hepatopoietin。由于贺自创名词，起初我误以为贺研究的是这种常见的因子，谢谢网友BIGBEN提供的信息），实际上就是“肝再生增强因子”（augmenter of liver regeneration，简称ALR），蛋白质序列完全一样。ALR早在1994年，就由Hagiya等人从大鼠中克隆（Hagiya et al,1994），其人的基因，也早在1996年由Giorda等人克隆并表达（Giorda et al,1996），这一切，贺福初等人在2000年在国际上发表的一篇论文的导言中也不得不承认（Li et al. 2000) 。而迟至1999年1月29日，贺福初等人才向GenBank提交了其所谓肝细胞生成素的序列，虽然换了个名称，实际上是同一种蛋白质，序列完全一样。贺福初把别人早就发现、克隆的蛋白质改了个名称（只有贺福初实验室用这个称呼，见Lange et al, 2001），就敢声称在国际上首次发现，欺世盗名到了这种程度，肆无忌惮到了这种程度，闻所未闻。”

    白字秀才（的确爱写白字，比如把hepatopoietin写成hematopoietin）为其辩解说：

－－－－－－

方舟子说贺福初等人在1999年向GenBank提供的hepatopoietin蛋白质顺序和1994年大鼠以及1996年人的 augmenter of liver regeneration,ALR的【蛋白质序列完全一样】。那么，贺的hepatopoietin和ALR当然就是同一个蛋白质了。方舟子说【实际上是同一种蛋白质，序列完全一样】。

那么，真是象方舟子说的这两个【蛋白质序列完全一样吗？】在GenBank中，贺等人最初提供过几个不完全的蛋白质顺序，在2000年，提供了比较完整的人的hepatopoietin的蛋白质顺序， 205个氨基酸:AAG38105. Reports hepatopoietin pro…[gi:11559826]。氨基酸顺序是

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而方舟子所谓的人的augmenter of liver regeneration,ALR，在基因库中是CAB87993. Reports augmenter of live…[gi:7576256]，氨基酸顺序是

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共204个氨基酸。差一个氨基酸！？如果他们真是同一个蛋白，贺福初为何在每次他们发表他们hematopoietin顺序的时候，都会提到以前的这个augmenter of liver regeneration?是他们太蠢还是太胆大，明目张胆地搞假？那些genebank的人员真比方舟子大虾的ID低吗？

慢！

我比较了这两个蛋白质的氨基酸顺序后，原来【欺世盗名】的不是贺福初，而是方舟子。

这两个蛋白质的205aa和204aa比较后，只有82％相同！在上述两个顺序的【】中，是不同的，也就是说其实这两个蛋白质的顺序有35个氨基酸的顺序是不一样的。

我不知道，这个信誉死亡站的方舟子是如何得出贺的hematopoietin和augmenter of liver regeneration【蛋白质序列是完全一样】的。但肯定方舟子自己是在【欺世盗名】。方舟子然后根据自己的愚蠢，一直发表文章，攻击贺福初等人的这个发现，把自己打扮成一个成功的“大架专家”。

方舟子真是个Joke。

－－－－－－－－

    我文中说得清清楚楚，我说的“蛋白质序列完全一样”指的是1999年1月29日贺福初等人向GenBank提交的其所谓肝细胞生成素的序列与别人此前测定的肝再生增强因子序列的比较而言。当时就应该可以确定贺福初“发现”的乃是别人早就克隆、测序的蛋白质，而不是新东西。白字秀才拿贺福初实验室在2000年补交的肝细胞生成素的完整序列（编号11559826）与别的实验室在1999年提交的肝再生增强因子完整序列（编号7576255，按：白字秀才写错了编号的最后一位数）相比，中间有一段不同，并不能用以否定我说的他们在1999年首次提交的序列与别人“完全一样”。

    那么，贺福初后来补交的完整序列与别人的相比，“只有82％相同”，是否就能说明是两种不同的蛋白质呢？是不是我当初对他的指责就错了呢？不。这两段蛋白质序列的不同部分都集中在中间的一段，而其他部分都一模一样，分子生物学专业人士都不难猜到，这种差异，乃是测序误差造成的，测的实际上是同一种东西。

    测序误差能达到18％？能。因为他们测的并非蛋白质氨基酸序列本身，测的是基因的核苷酸序列，然后再根据遗传密码，从基因的核苷酸序列推断出蛋白质的氨基酸序列。只要核苷酸序列略有不同，缺了一、两个核苷酸，就可能造成“阅读框”变动而导致氨基酸序列大为不同（因为每三个核苷酸编码一个氨基酸）。因此，要比较序列差异，应该比较原始数据——基因的核苷酸序列。这一比较，就一目了然了（上面一行为贺福初的“肝细胞生成素”基因的核苷酸序列，下面一行为肝再生增强因子基因的核苷酸序列）：

1    ATGGCGGCGCCCGGCGAGCGGGGCCGCTTCCACGGCGGGAACCTCTTCTTCCTGCCGGGG  60     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||689  ATGGCGGCGCCCGGCGAGCGGGGCCGCTTCCACGGCGGGAACCTCTTCTTCCTGCCGGGG  748

61   GGCGCGCGCTCCGAGATGATGGACGACCTGGCGACCGACGCGCGGGGCCGGGGCGCGGGG  120     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||749  GGCGCGCGCTCCGAGATGATGGACGACCTGGCGACCGACGCG–GGGCCGGGGCGCGGGG  806

121  CGGAGAGACGCGGCCGCCTCGGCCTCGACGCCAGCCCAGGCGCCGACCTCCGATTCTCCT  180     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||807  CGGAGAGACGCGGCCGCCTCGGCCTCGACGCCAGCCCAGGCGCCGACCTCCGATTCTCCT  866

181  GTCGCCGAGGACGCCTCCCGGAGGCGGCCGTGCCGGGCCTGCGTCGACTTCAAGACGTGG  240     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||867  GTCGCCGAGGACGCCTCCCGGAGGCGG-CGTGCCGGGCCTGCGTCGACTTCAAGACGTGG  925

241  ATGCGGACGCAGCAGAAG  258     ||||||||||||||||||926  ATGCGGACGCAGCAGAAG  943

    从上面的比较可以看出，贺福初的“肝细胞生成素”基因的核苷酸序列和肝再生增强因子基因的核苷酸序列实际上完全相同（仅有3个核苷酸不同，属于误差），为同一种东西。推断出来的蛋白质序列之所以有12％的差异，乃是测序误差造成的：在不容易准确测定的GC区域，贺福初比别人多测出了两个核苷酸，导致“阅读框”改变，因此这一段推断出来的蛋白质氨基酸序列自然是出现了较大的差异；后面又多测出了一个核苷酸，刚好又回复了原有的“阅读框”。

    可见，新补充的数据更进一步证明了贺福出自称“新发现”的蛋白质实际上是别人早已发现的。“白字秀才”（“宋非”、“4848”）又一次自以为抓住了我什么把柄，却又一次在生物学问题上出丑，才“真是个Joke”。

    贺福初的确是个成功的学术骗子，不仅靠伪造成果评上了院士，晋升少将，而且现在在主持“人类蛋白质组工程”，掌握着高达40亿元的资金，成了中国生物学界最有钱的人之一。曾经有国外记者问我对中国花这么多的钱搞“人类蛋白质组工程”这种“大科学”有什么看法，我的回答是：中国要不要扔进这么多钱搞“大科学”，要好好讨论，如果真要搞的话，也不能让一个学术骗子来领导！

    讽刺的是，《科学时报》哪壶不开提哪壶，竟然请贺福初来评论黄禹锡事件，而贺福初也义正词严地声称：

    “单纯就科学造假事件而言，在人数众多的学术界，偶尔有个别人一时糊涂，做出不端行为，不足为奇。但鉴于科学研究职业对数据真实性的铁律要求，‘作伪’一旦查实，应该严肃处理。”

    说得很好，但是我们还要问一句：谁来严肃处理贺福初？

附：

方舟子应该就hematopoietin,向贺福初等人叩头道歉

作者：白字秀才

方舟子在它的信誉死亡站的列此存照中，一直指控说贺福初等人发现的hematopoietin蛋白的氨基酸顺序和别人早就发现的 augmenter of liver regeneration，简称ALR是一模一样的。意思是贺福初等人造谣撞骗，不但欺负中国人，还欺负到国外，欺负国际蛋白基因库的专家。当然了，它方大专家是无法被欺骗的。

以下是摘录之方舟子的《一个成功的学术骗子贺福初院士 》

【二、所谓“在国际上首次发现肝细胞生成素”“1994年以后，他带领课题组发现、克隆并命名了肝细胞生成素，证明其为特异刺激肝细胞增殖和肝脏再生的新型细胞因子，建立了目前国际上有关肝脏和胎肝规模最大、最系统的基因表达谱。”（“全国五四青年奖章获得者”介绍）

“人源HPO（方按：即指肝细胞生成素）由该课题组在国际上首次发现，重组HPO为国际上首次研制成功。”（“中国青年科学家奖”获奖者介绍）

“他成功地发现人类肝细胞生成素（HPO），并在国际上首次公布其序列”（《他没有留学背景——记中科院39岁院士贺福初》，《中国青年报》2001年12月11日）

根据贺福初实验室发表的论文和蛋白质序列，他号称首先发现、克隆并命名的肝细胞生成素HPO，虽然他将其英文写成hepatopoietin，但并不是肝细胞生长因子（hepatocyte growth factor，有时也写做hepatopoietin。由于贺自创名词，起初我误以为贺研究的是这种常见的因子，谢谢网友BIGBEN提供的信息），实际上就是“肝再生增强因子”（augmenter of liver regeneration，简称ALR），蛋白质序列完全一样。ALR早在1994年，就由Hagiya等人从大鼠中克隆（Hagiya et al,1994），其人的基因，也早在1996年由Giorda等人克隆并表达（Giorda et al,1996），这一切，贺福初等人在2000年在国际上发表的一篇论文的导言中也不得不承认（Li et al. 2000) 。而迟至1999年1月29日，贺福初等人才向GenBank提交了其所谓肝细胞生成素的序列，虽然换了个名称，实际上是同一种蛋白质，序列完全一样。贺福初把别人早就发现、克隆的蛋白质改了个名称（只有贺福初实验室用这个称呼，见Lange et al, 2001），就敢声称在国际上首次发现，欺世盗名到了这种程度，肆无忌惮到了这种程度，闻所未闻。】

方舟子说贺福初等人在1999年向GenBank提供的hepatopoietin蛋白质顺序和1994年大鼠以及1996年人的 augmenter of liver regeneration,ALR的【蛋白质序列完全一样】。那么，贺的hepatopoietin和ALR当然就是同一个蛋白质了。方舟子说【实际上是同一种蛋白质，序列完全一样】。

那么，真是象方舟子说的这两个【蛋白质序列完全一样吗？】在GenBank中，贺等人最初提供过几个不完全的蛋白质顺序，在2000年，提供了比较完整的人的hepatopoietin的蛋白质顺序， 205个氨基酸:AAG38105. Reports hepatopoietin pro…[gi:11559826]。氨基酸顺序是

1 maapgergrf hggnlfflpg garsemmddl atda【rgrgag rrdaaasast paqaptsdsp61 vaedasrrrp 】cracvdfktw mrtqqkrdtk fredcppdre elgrhswavl htlaayypdl121 ptpeqqrdma qfihlfskfy pceecaedlr krlcrnhpdt rtracftqwl chlhnevnre181 lgkpdfdcsk vderwrdgwk dgscd

而方舟子所谓的人的augmenter of liver regeneration,ALR，在基因库中是CAB87993. Reports augmenter of live…[gi:7576256]，氨基酸顺序是

1 maapgergrf hggnlfflpg garsemmddl atda【gpgrga errgrlglda spgadlrfsc61 rrgrlpeaa】c racvdfktwm rtqqkrdtkf redcppdree lgrhswavlh tlaayypdlp121 tpeqqqdmaq fihlfskfyp ceecaedlrk rlcrnhpdtr tracftqwlc hlhnevnrkl181 gkpdfdcskv derwrdgwkd gscd

共204个氨基酸。差一个氨基酸！？如果他们真是同一个蛋白，贺福初为何在每次他们发表他们hematopoietin顺序的时候，都会提到以前的这个augmenter of liver regeneration?是他们太蠢还是太胆大，明目张胆地搞假？那些genebank的人员真比方舟子大虾的ID低吗？

慢！

我比较了这两个蛋白质的氨基酸顺序后，原来【欺世盗名】的不是贺福初，而是方舟子。

这两个蛋白质的205aa和204aa比较后，只有82％相同！在上述两个顺序的【】中，是不同的，也就是说其实这两个蛋白质的顺序有35个氨基酸的顺序是不一样的。

我不知道，这个信誉死亡站的方舟子是如何得出贺的hematopoietin和augmenter of liver regeneration【蛋白质序列是完全一样】的。但肯定方舟子自己是在【欺世盗名】。方舟子然后根据自己的愚蠢，一直发表文章，攻击贺福初等人的这个发现，把自己打扮成一个成功的“大架专家”。

方舟子真是个Joke。

(XYS20060116)

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